Медицинский центр «Агапе» был создан в 1993 году.

В течение первых 10 лет медцентр участвовал в совместных проектах с НИИ Педиатрии по организации досуга пациентов-детей с тяжелыми патологиями, содействовал сотрудничеству НИИ с зарубежными больницами в области лечения пациентов с редкими заболеваниями, совместно с Ассоциацией коренных малочисленных народов Севера и Дальнего Востока реализовывал проекты по изучению распространенности и профилактике рахита и эндемического зоба.

В 2004 году в Москве начала работать многопрофильная клиника для всех возрастных категорий, оснащенная самым современным оборудованием, оказывающая услуги по 17 врачебным специальностям. За это время более 15000 пациентов получили квалифицированную медицинскую помощь.